El GIMG tiene como líneas principales de investigación: Genética, Microbiología, Mutagénesis y Fotoprotección. Destacándose el estudio de la diversidad genética y estructura poblacional de especies de interés biológico, conservación de especies de plantas de importancia agrícola mediante el uso de la genética y la biotecnología vegetal, mejoramiento genético, biotecnología de plantas de interés agrícola, estudio de diversidad genética de comunidades microbianas, estudio de biodegradación de hidrocarburos, bio-prospección, identificación taxonómica y preservación de colecciones microbianas, genómica microbiana, evaluación genotoxicológica, quimioprevención y estudio de fotoprotectores naturales.